百日咳与普通咳嗽的主要区别在于病原体、病程特征和症状严重程度。百日咳由百日咳杆菌引起，表现为阵发性痉挛性咳嗽伴鸡鸣样回声；普通咳嗽多由病毒或非特异性刺激导致，症状较轻且无特征性咳声。
1、病原体差异
百日咳由百日咳鲍特菌感染引发，具有高度传染性，通过飞沫传播。普通咳嗽常见病原体包括鼻病毒、冠状病毒等呼吸道病毒，或由冷空气、烟雾等非感染性刺激触发。百日咳需通过细菌培养或核酸检测确诊，而普通咳嗽通常无须特殊病原学检查。
2、咳嗽特征
百日咳咳嗽呈阵发性痉挛，发作时连续十余声至数十声短促咳声，末段伴随高调鸡鸣样回声，夜间加重且易引发呕吐。普通咳嗽多为单声或断续咳嗽，无规律性声响特征，持续时间较短，较少伴随呕吐等剧烈反应。
3、病程进展
百日咳典型分为卡他期、痉咳期和恢复期，全程可达2-3个月，痉咳期持续2-6周。普通咳嗽病程通常1-3周，症状呈自限性逐渐减轻，无明确分期表现。
4、并发症风险
百日咳可并发肺炎、脑病、肋骨骨折等严重情况，婴幼儿可能出现呼吸暂停。普通咳嗽并发症较少，偶见继发支气管炎或中耳炎，多数预后良好。
5、防治措施
百日咳需隔离治疗，抗生素首选阿奇霉素干混悬剂、红霉素肠溶片或复方磺胺甲噁唑片，重症需住院监护。普通咳嗽以对症治疗为主，可选用右美沙芬愈创甘油醚糖浆、氨溴索口服溶液等止咳祛痰药物，无须特殊隔离。
预防百日咳需按时接种百白破疫苗，接触感染者后可采用红霉素肠溶片预防性用药。普通咳嗽预防以增强体质、避免受凉为主。无论何种咳嗽，若出现呼吸急促、口唇发绀或持续高热，均需及时就医。咳嗽期间保持室内空气湿润，避免辛辣刺激食物，婴幼儿应少量多次喂食以防呛咳。