目前尚无明确的预防膈肌缺损的方法，因为其发生往往是由于先天性的原因。然而，一些研究表明，孕期保持良好的健康习惯可能降低膈肌缺损的发生率，例如：
1.饮食均衡，避免摄入过多的热量和不良营养物质。
2.避免接触致畸形物质，在孕期尽量减少或避免暴露在有害物质环境中。
3.孕期定期进行产前检查，及时发现先天性疾病和异常情况。
4.孕期不吸烟、不酗酒，避免使用毒品和某些药物，以保证胎儿的健康发育。
值得注意的是，即使进行了上述的预防措施，也不能完全避免膈肌缺损的发生。若发现胎儿出现消化不良和呼吸困难等症状，应尽早就医并进行适当的治疗。
