室间隔缺损特别是高位和房室管型者，在修补时易引起：房室传导阻滞；主动脉瓣或三尖瓣损伤；空气栓塞等并发症。
1、房室传导阻滞在开展室间隔缺损修补的早期，永久性房室传导阻滞的发生率为1％一12％。随着手术技术的改进，如采用超越缝线、操作轻柔、避免过分牵拉或钳夹等措施后，这一房室传导阻滞并发症已大为减少。在笔者的210例室间隔缺损直视缝合和修补术中，无1例发生永久性房室传导阻滞。
在复苏后即出现完全性房室传导阻滞者，应再次行心肺转流，打开心脏切口，在缺损后下角处拆除1-2根缝线，于距离缺损后下缘稍远处，加缝1一2根缝线。如心室节律慢，血压低，则应在静脉内滴注异丙肾上腺素0.5mg，使心率维持在80次／分以上。在关胸前，于心肌表面安置起搏电极，并接连起搏器，把心率定在90-100次／分进行起搏。对完全性或不完全性右束支传导阻滞对患者影响不大，不需特殊处理。
2、主动脉瓣关闭不全大型缺损，主动脉瓣环下无间隔组织者，缝合时，如缝线牵拉过紧，能使主动脉瓣环变形，易造成关闭不全。若缝线安置过深、过高；就能伤及主动脉瓣膜，同样导致关闭不全。因此，对大型缺损修补时，要采用塑料织物，并辨明主动脉瓣部位，将缝线安置在主动脉瓣环处。手术中一旦发现关闭不全，就要及时拆除、重新缝合。
3、三尖瓣关闭不全或狭窄缝合隔瓣后方缺损时，甚易伤及瓣膜或其腱索，造成关闭不全。笔者曾有1例于缺损修补后，临床上出现严重的关闭不全，手术后21个月死亡。尸检发现缺损修补不够完善，并再度撕裂，在缺损后下缘处有一根缝线穿过隔瓣腱索，固定于缺损下缘，形成关闭不全，并将室间隔缺损变为左心室向右一温和右心房同时分流，造成严重后果。导致三尖瓣关闭不全的另一可能性，是在显露缺损时，曾切断腱索未予缝合或复位。因此，在大型缺损修复后，如不将前瓣牵开，可能将缺损后缘与隔瓣根部和前瓣根部或环部缝在一起，造成三尖瓣口缩小或狭窄。
4、缺损修补不完善缺损修补后仍有大的残余分流者，约为6％。常发生在大型缺损修补，部位多半在后下角处。原因可能是，缝针距离太大，遗留间隙；缝针太浅，容易脱落；转移缝线未将隔瓣下方与缺损边缘之间的夹角关闭等。故在缺损修补时，应注意这几点。修补完毕后，要测试缺损修补是否完善，用弯钝头探子探查缺损边缘缝线之间有无间隙；或作膨胀肺试验，左心室加压注射等渗盐水，观察补片周围有无漏血、漏液。
5、空气或其他栓子栓塞在室间隔缺损修补过程中，特别是采用左心房引流者，空气可通过缺损进入左心室，在缝合心脏切口后，导致冠状动脉气栓，引起严重后果。常规地把手术台摇到头低脚高，并利用左心室心尖引流管排除左心室内气体，把右手放在心后轻轻震动，而后把心尖抬高，用注射器穿刺心尖处抽出心腔内、肺动脉和升主动脉内可能残余的空气，再于升主动脉根部插入一放气的槽针，而后松开升主动脉钳闭使心脏复苏。如发现冠状动脉气栓发生，则立即加大流量，提高灌注压，以手指向远侧方向挤压冠状动脉，驱除气栓。如脑部发生栓塞，手术后应已高浓度氧或纯氧作机械呼吸，促进微气栓的吸收；在伴有昏迷和抽搐者，应于手术后5日内采取低温疗法，咽部温度维持在32-34℃，并采用防治脑水肿的措施。
应用人造织物修补缺损时，应将织物片清洗干净，用电烙烫平边缘，以免线头脱落，形成栓子；在体外循环灌注系统中，多处采用微孔过滤器使防止微栓子栓塞的有效措施。
6、防止心脏膨胀和心室颤动大型缺损合并肺动脉高压，特别是在高阻力－低储备类型的患者，左、右心室常肥大，甚至劳损，对缺氧的耐受性较差；手术后肺动脉压力和阻力一般下降不满意；这就不但需要保持一个好的左心室功能，更需要保持一个好的右心室功能。故在心内直视手术中，应加强心肌保护，尽量缩短心脏缺血时间，复苏时千万不要使心脏膨胀，损伤心肌纤维和阻碍心内膜下血液供应，必须使心脏保持在排空状态。如发生心室颤动，必须尽早以低功率电击除颤，否则心内膜下的血运亦会减少，颤动的心肌耗氧量比空跳者增加。这两种情况均对心肌收缩力的恢复不利，削弱心脏特别是右心室排血通过较高的肺血管阻力的力量，增加手术后出现低心排征，甚至心力衰竭的可能性。
