脑疝的恢复程度主要取决于原发病的严重程度、脑疝的持续时间以及治疗是否及时，部分患者可能完全恢复，部分患者可能遗留不同程度的神经功能障碍。
脑疝是颅内压增高导致脑组织移位并压迫脑干等关键结构的急危重症，恢复程度与脑疝类型密切相关。早期小脑幕切迹疝患者若在30分钟内解除压迫，通过脱水降颅压、手术清除血肿或切除肿瘤等治疗，可能完全恢复神经功能。枕骨大孔疝患者因直接压迫延髓生命中枢，即使及时手术干预，仍可能遗留呼吸循环功能障碍。弥漫性脑肿胀引起的脑疝预后较差，即使存活也常伴随认知障碍、肢体瘫痪等后遗症。儿童因脑组织代偿能力强于成人，恢复概率相对较高。老年患者或合并基础疾病者恢复程度通常受限。
部分特殊情况下恢复效果可能更显著。由可逆性病因如低钠血症诱发的脑疝，纠正电解质紊乱后神经功能可基本复原。短暂性脑疝发作且未造成脑干永久性损伤者，经高压氧等康复治疗可能显著改善症状。某些非占位性病变引起的脑疝，在急性期控制后通过神经修复治疗可获得较好预后。但继发于大面积脑梗死或严重颅脑外伤的脑疝，即使积极治疗仍可能遗留严重残疾。
脑疝患者度过急性期后需长期进行康复训练，包括运动功能锻炼、语言训练和认知康复等。家属应协助患者定期复查头颅CT或MRI，监测脑积水等并发症。饮食上需保证高蛋白、高维生素摄入，避免高盐饮食加重脑水肿。对于遗留吞咽困难者应采用糊状食物防误吸，肢体功能障碍者需预防压疮和深静脉血栓。心理疏导对改善患者生活质量同样重要。
