三个月婴儿大便呈水状可能是正常的生理现象，也可能是异常情况。母乳喂养的婴儿可能出现稀便，若伴随发热、哭闹或血便则需警惕病理性腹泻。
母乳喂养的婴儿大便通常呈金黄色糊状或水状，每日排便可达5-6次，这与母乳中低聚糖促进肠道蠕动有关。配方奶喂养的婴儿大便相对稠厚，若突然变稀需观察是否冲调比例不当或奶粉过敏。天气变化、腹部受凉等也可能导致短暂性大便性状改变，通常24小时内自行恢复。
轮状病毒感染会引起蛋花汤样水便，伴有呕吐和低热，需用蒙脱石散和口服补液盐预防脱水。细菌性肠炎常见黏液脓血便，需化验大便常规确诊。乳糖不耐受表现为泡沫状酸臭水便，需改用无乳糖配方奶粉。牛奶蛋白过敏除腹泻外还可能出现湿疹，需深度水解蛋白奶粉喂养。
家长应记录排便次数和性状变化，保持臀部清洁干燥以防尿布疹。母乳妈妈需避免进食生冷或高脂食物。若水样便持续超过48小时、出现嗜睡或尿量减少，须立即就医进行便常规和轮状病毒检测。注意奶瓶消毒和手部卫生，接种轮状病毒疫苗可降低感染风险。
