龙眼肉适量食用一般无明显副作用，但过量可能引起上火、胃肠不适等反应。龙眼肉含有较高糖分和热量，长期大量食用可能影响血糖水平或导致体重增加。特殊人群如糖尿病患者、湿热体质者需谨慎食用。
龙眼肉性温味甘，正常食用可补益心脾、养血安神。其含有的葡萄糖、蔗糖等成分能快速补充能量，适合气血不足引起的失眠健忘。但每日建议食用量不超过15-20克，尤其阴虚火旺者可能出现口干舌燥、牙龈肿痛等上火症状。食用后建议多饮水促进代谢。
胃肠功能较弱者空腹大量进食龙眼肉可能引发腹胀腹泻，因其含有的鞣酸会刺激胃肠黏膜。建议搭配山药、小米粥等健脾食物同食。龙眼肉升糖指数较高，糖尿病患者食用前应监测血糖，妊娠期女性过量食用可能加重妊娠糖尿病风险。对龙眼过敏者会出现皮肤瘙痒、红疹等反应，应立即停食。
日常食用龙眼肉可去核后与银耳、莲子同炖，既降低燥性又增强滋补效果。储存时需密封防潮，霉变龙眼肉会产生黄曲霉素等有害物质。若出现严重不良反应如呼吸困难、持续腹泻，应及时就医。合理控制摄入量并注意体质差异，能有效避免副作用发生。