常吃银耳一般无明显副作用，但过量食用可能引起胃肠不适或过敏反应。银耳富含膳食纤维和胶质，合理食用有助于健康。
银耳作为传统滋补食材，含有丰富的多糖类物质和膳食纤维，适量食用可促进肠道蠕动、增强免疫力。其胶质成分对皮肤保湿有一定帮助，但每日摄入量建议控制在10-15克干品为宜。胃肠功能较弱者可能出现腹胀，因银耳中的膳食纤维需要肠道菌群参与分解。部分人群对菌类食物存在过敏风险，表现为皮肤瘙痒或呼吸道症状，此类情况应立即停止食用。银耳泡发时间过长或储存不当可能滋生米酵菌酸，引发食物中毒风险。
特殊人群需注意食用方式。糖尿病患者需计算银耳羹中的添加糖分，避免影响血糖控制。术后患者应咨询医生，因银耳的抗凝血特性可能干扰伤口愈合。银耳中的腺嘌呤核苷可能增强华法林等抗凝药物效果，服药期间需谨慎。银耳羹长时间熬煮会破坏部分活性成分，建议隔水炖煮1-2小时。市售鲜银耳可能存在二氧化硫残留问题，应选择正规渠道购买干燥银耳。
建议采用隔日食用方式，每次食用量不超过一碗。泡发时使用冷水并更换2-3次水，炖煮前剪去根部硬结。出现消化不良时可搭配山楂、陈皮等助消化食材。过敏体质者初次尝试应少量测试，食用后观察24小时身体反应。银耳宜与莲子、百合等清淡食材搭配，避免与浓茶、萝卜同食影响营养吸收。储存时应保持干燥通风，泡发后银耳须冷藏并在24小时内食用完毕。