麦门冬汤与养阴清肺汤的主要区别在于成分侧重与适应症差异。麦门冬汤以麦冬、半夏为主，侧重滋阴降火、和胃止呕；养阴清肺汤以生地、玄参为主，侧重清肺润燥、解毒利咽。
麦门冬汤由麦冬、半夏、人参、甘草、粳米组成，麦冬滋阴润肺为君药，半夏降逆和胃为臣药，适用于肺胃阴伤导致的干咳少痰、咽喉干燥、呕吐呃逆。养阴清肺汤由生地、玄参、麦冬、白芍、贝母、丹皮、薄荷、甘草组成，生地清热凉血为君药，玄参解毒利咽为臣药，适用于肺燥阴伤导致的咽喉肿痛、声音嘶哑、干咳无痰或痰中带血。
麦门冬汤更适用于慢性消耗性疾病如肺结核、慢性胃炎等伴随的阴虚火旺证，其组方特点在于滋阴与降逆并用。养阴清肺汤更适用于急性呼吸道感染如急性咽炎、扁桃体炎等伴随的燥热伤阴证，其组方特点在于养阴与清热并重。
使用中药方剂需经中医师辨证施治，麦门冬汤适合长期阴虚体质调理，服药期间忌食辛辣燥热食物；养阴清肺汤适合短期燥热症状缓解，用药后需注意保暖防寒。两者均含甘润滋腻成分，脾虚便溏者慎用，建议服药期间保持饮食清淡，适当食用银耳、百合等润肺食材辅助调理。