花椒具有温中止痛、杀虫止痒、祛湿散寒等功效，主要用于缓解胃肠冷痛、呕吐泄泻、蛔虫腹痛、湿疹瘙痒等症状。
1、温中止痛
花椒性温味辛，归脾、胃经，能有效缓解因脾胃虚寒引起的脘腹冷痛、食欲不振。其挥发油成分可刺激胃肠黏膜，促进消化液分泌，改善功能性消化不良。寒性腹泻者可用花椒5克与生姜煎服。
2、杀虫止痒
花椒所含的柠檬烯、芳樟醇等成分对蛔虫、蛲虫有麻痹作用，传统用法是将花椒水煎液灌肠驱虫。外用花椒酒精浸泡液涂抹患处，可缓解湿疹、皮肤瘙痒等症。
3、祛湿散寒
花椒能促进血液循环，对风寒湿痹引起的关节疼痛有缓解作用。民间常用花椒与粗盐炒热后布包热敷患处，或加入泡脚水中改善手脚冰凉症状。
4、抗菌消炎
实验研究表明花椒对金黄色葡萄球菌、大肠杆菌等常见致病菌有抑制作用。口腔溃疡时可用花椒煮水漱口，但浓度过高可能刺激黏膜。
5、局部麻醉
花椒中的羟基甲位山椒素具有轻微局部麻醉效果，牙痛时可暂用花椒粒咬合于患处缓解疼痛，但需及时就医处理根本病因。
使用花椒时需注意阴虚火旺者慎用，孕妇禁用口服；外用时避免接触眼睛及黏膜；日常食疗可搭配肉类去腥增香，但单次用量不宜超过3克。出现严重胃肠不适或过敏反应应立即停用，花椒不能替代药物治疗器质性疾病，症状持续或加重时需及时就医。