前列腺增生微创手术可能存在后遗症，但多数患者术后恢复良好。常见后遗症包括尿失禁、尿道狭窄、逆行射精等，通常可通过规范治疗缓解。
尿失禁是术后较常见的短期后遗症，多因手术刺激尿道括约肌导致暂时性控尿功能异常，通常3-6个月内逐渐恢复。尿道狭窄多因术后瘢痕形成引起排尿困难，需通过尿道扩张术改善。逆行射精因手术影响膀胱颈结构，精液可能逆流入膀胱而非正常排出，但对健康无实质影响。
少数患者可能出现反复尿路感染、血尿持续或性功能障碍。感染多与术后留置导尿管相关，需加强抗感染治疗。血尿通常2-4周内消失，若持续需排查创面愈合异常。性功能障碍发生率较低，可能与心理因素或神经损伤有关。
术后应保持会阴清洁，每日饮水1500-2000毫升促进排尿，避免憋尿及久坐压迫前列腺区域。3个月内禁止骑自行车、提重物等增加腹压的活动，定期复查尿流率及残余尿量。饮食宜清淡，限制辛辣刺激食物，适量补充锌元素有助于前列腺修复。出现发热、严重血尿或排尿疼痛加剧时需及时就医。