牙根烂到肉里通常可以拔除，但需根据牙周组织感染程度和全身健康状况综合评估。牙根严重龋坏可能引发根尖周炎、牙槽骨吸收等问题，建议尽早就医处理。
当龋坏牙根已侵入牙龈软组织时，若局部炎症可控且无严重骨质破坏，口腔外科医生可通过微创拔牙术清除病灶。术前需拍摄牙片评估牙根形态与周围组织关系，术中可能需切开牙龈、分根取出或少量去骨。术后需配合抗生素预防感染，并严密观察创面愈合情况。
若存在急性化脓性感染、严重糖尿病或凝血功能障碍等情况，需先控制基础疾病再拔牙。对于与下颌神经管毗邻的残根，盲目拔除可能导致神经损伤，此时需采用冠向牵引术或正畸辅助拔牙等特殊技术。
拔牙后24小时内避免漱口和剧烈运动，进食温凉流质食物，用对侧牙齿咀嚼。48小时后可轻柔刷牙但避开创面，按医嘱使用氯己定含漱液维护口腔卫生。若出现持续出血、剧烈疼痛或发热，应立即复诊。日常应注意早晚使用巴氏刷牙法，定期洁牙预防邻牙龋坏，糖尿病患者需加强血糖监测和口腔护理。