晚期梅毒通常难以彻底治愈，但规范治疗可有效控制病情进展。晚期梅毒指感染后超过2年未治疗或治疗不彻底的情况，可能引发神经梅毒、心血管梅毒等严重并发症。
晚期梅毒的治疗目标以控制症状和防止器官进一步损伤为主。青霉素类药物是首选治疗方案，例如苄星青霉素注射液或普鲁卡因青霉素注射液，需根据医嘱完成全程治疗。神经梅毒患者可能需要静脉注射青霉素G钠，同时配合脑脊液检查评估疗效。心血管梅毒若已造成主动脉瓣关闭不全等器质性病变，药物仅能延缓病情，部分患者需结合心血管外科手术干预。
少数患者即使完成规范治疗，血清学检测可能持续呈现低滴度阳性，称为血清固定现象。这种情况不代表治疗失败，但需长期随访监测。合并HIV感染的患者治疗效果可能更差，需延长疗程并加强免疫调节治疗。先天性晚期梅毒患儿可能出现哈钦森三联征等不可逆损害，需多学科联合管理。
晚期梅毒患者治疗期间应避免性生活直至医生确认无传染性，密切接触者需同步筛查。日常注意监测心血管和神经系统症状，如胸痛、行走不稳等及时就医。保持规律作息和均衡饮食有助于维持免疫功能，限制酒精摄入可减少药物性肝损伤风险。定期复查血清学试验和器官功能评估是长期管理的核心，心理疏导对改善治疗依从性具有重要作用。