清理牙石一般不会导致牙龈萎缩，规范操作有助于改善牙龈健康。牙石清除主要通过超声波洁治或手工刮治，专业操作可避免损伤牙龈组织。
牙石是钙化的菌斑沉积物，长期堆积会刺激牙龈引发炎症。规范化的洁治术能精准清除龈上及龈下牙石，消除局部刺激因素。操作时器械与牙面保持适当角度，避免过度加压或反复刮治同一部位。治疗后可能出现短暂敏感，但牙龈组织会在1-2周内完成自我修复。定期洁牙能有效控制菌斑生物膜，预防牙周炎进展，反而有助于维持牙龈附着高度。
少数情况下，若操作者技术不熟练或患者本身存在薄龈型生物型，可能出现机械性牙龈损伤。过度刮治可能破坏结合上皮附着，或损伤牙骨质表面。伴有严重牙周炎的患者，洁治后牙根暴露可能被误认为牙龈萎缩。这类情况需配合牙周探诊和X线检查鉴别，必要时通过膜龈手术修复缺损。
建议每6-12个月进行专业牙周维护，选择有资质的口腔机构进行操作。日常使用巴氏刷牙法配合牙线清洁，控制菌斑形成速度。若洁牙后出现持续牙龈出血、牙齿松动等异常，需及时复诊评估。