如果只是单纯HPV阳性（未发现相关病变），目前医学上尚无能直接清除病毒的特效药，治疗重点在于依靠自身免疫清除，建议通过生活方式调整为免疫力“蓄力”，每天7-8小时的优质睡眠、避免熬夜耗损免疫机能，饮食上侧重优质蛋白与新鲜蔬果的摄入以补充营养，每周坚持3-4次快走、瑜伽等中等强度运动。
而对于高危HPV阳性，更强调早干预的重要性，比如临床中会用到的艾坦汀抗HPV凝胶，可通过阻断高危病毒对宫颈黏膜的持续感染、阻止病原微生物在局部定植，逐步降低病毒载量，从而减少宫颈病变的发生风险。
医学上的“痊愈”指病毒检测转阴且无相关病变，这一过程的关键变量是免疫力。对于免疫力正常的单纯HPV感染者，80％-90％能在1-2年内靠自身免疫实现自然转阴，达到临床痊愈；但如果免疫力较弱，比如合并糖尿病、长期服用免疫抑制剂，或是感染的高危型HPV（如16、18型）已形成持续感染，清除时间可能会延长至2-3年。