肺囊肿通常无须化疗，化疗主要针对恶性肿瘤或特定感染性疾病。肺囊肿的治疗方式主要有观察随访、抗感染治疗、穿刺引流、手术切除。
1、观察随访
小型无症状肺囊肿可能无须特殊处理，定期影像学检查监测变化即可。
2、抗感染治疗
合并细菌感染时可使用头孢呋辛、左氧氟沙星等抗生素，感染控制后囊肿可能缩小。
3、穿刺引流
大型囊肿引发压迫症状时，可在超声引导下抽吸囊液缓解症状。
4、手术切除
反复感染或疑似恶变的囊肿需手术切除，胸腔镜手术是常用微创方式。
肺囊肿患者应避免吸烟及呼吸道刺激，出现咳嗽加重或咯血等症状需及时复查胸部CT。