生姜具有一定的杀菌作用，其活性成分对部分细菌有抑制作用，但不可替代专业消毒或药物治疗。
生姜中的姜辣素、姜烯酚等成分在体外实验中显示出对金黄色葡萄球菌、大肠杆菌等常见致病菌的抑制效果。日常用生姜煮水漱口可辅助减少口腔细菌滋生，生姜汁涂抹皮肤轻微创面也可能降低局部感染概率。生姜的抗菌机制主要与其破坏细菌细胞膜结构、干扰代谢过程有关，对幽门螺杆菌等胃肠道病原体也有一定抑制作用。
生姜的杀菌效果受浓度和作用时间限制，无法达到医用消毒剂标准。对于深部感染、耐药菌感染或严重创伤，生姜无法替代抗生素治疗。实验数据显示生姜提取物需高浓度长时间作用才显现抑菌效果，日常食用剂量难以达到有效杀菌浓度。生姜对病毒、真菌的抑制作用较弱，不能用于器械消毒或伤口深度处理。
使用生姜杀菌需注意过敏反应，胃肠溃疡患者应避免空腹大量食用。出现明确感染症状如发热、化脓时须及时就医，不可依赖生姜治疗。将生姜作为饮食辅助时，建议每日食用量不超过10克鲜姜，可搭配蒜、葱白等增强抗菌效果，但需在医生指导下规范使用抗菌药物。
