菟丝子可能引起胃肠不适、过敏反应、肝肾负担加重、内分泌紊乱等副作用。菟丝子作为中药材，需在医生指导下合理使用，避免自行大剂量或长期服用。
1、胃肠不适过量服用菟丝子可能导致恶心呕吐、腹胀腹泻等胃肠刺激症状，与其中含有的树脂类成分有关。出现症状时应立即停用，可遵医嘱使用蒙脱石散、双歧杆菌三联活菌胶囊、铝碳酸镁片等药物缓解。
2、过敏反应部分人群接触菟丝子后会出现皮肤瘙痒、红疹等过敏表现，严重者可发生喉头水肿。过敏体质者初次使用需谨慎，发生过敏时可使用氯雷他定片、地塞米松注射液、葡萄糖酸钙注射液治疗。
3、肝肾负担长期大剂量服用可能增加肝肾代谢负担，尤其肝肾功能不全者可能出现指标异常。用药期间建议定期监测肝肾功能，必要时使用护肝片、尿毒清颗粒、复方α-酮酸片等辅助药物。
4、内分泌紊乱菟丝子具有类雌激素作用，不当使用可能导致月经周期改变、乳腺增生等内分泌失调症状。出现异常应及时停药，可遵医嘱使用黄体酮胶囊、逍遥丸、乳癖消片等调节。
使用菟丝子期间应避免辛辣刺激饮食，出现严重副作用需立即就医，孕妇及哺乳期妇女禁用该药材。
