生殖器疱疹治好后可能会复发。生殖器疱疹是由单纯疱疹病毒2型感染导致的性传播疾病，病毒会长期潜伏在神经节中，当免疫力下降时可能再次激活引起复发。
多数患者复发前会出现局部灼热、瘙痒或麻木等前驱症状，随后在生殖器或肛周区域出现簇集性水疱，破溃后形成浅表溃疡。复发频率因人而异，部分患者可能每年发作数次，部分患者可能数年才发作一次。复发症状通常比初发时轻微，病程更短，愈合更快。诱发因素包括熬夜、压力大、感冒发热、月经期或局部皮肤摩擦等。
少数患者可能出现频繁复发，每年发作超过6次，称为频繁复发性生殖器疱疹。这类患者往往伴随细胞免疫功能异常，病毒载量较高。极少数免疫缺陷患者可能出现疱疹性角膜炎、疱疹性脑炎等严重并发症，需要高度警惕。
建议复发期间保持患处清洁干燥，避免性接触，穿宽松棉质内衣。规律作息、适度运动有助于增强免疫力减少复发。频繁复发者可遵医嘱进行长期抑制治疗，使用阿昔洛韦片、泛昔洛韦胶囊、伐昔洛韦片等抗病毒药物。出现全身症状或皮损持续不愈时应及时就医。
