先天性高位肩胛骨可能出现疼痛，疼痛程度与肩胛骨畸形程度、伴随肌肉骨骼异常及日常活动负荷有关。
早期可能表现为肩部酸胀或疲劳感，与肩胛骨位置异常导致周围肌肉代偿性紧张有关。建议避免背包过重或单侧负重活动。
上肢外展或旋转时易诱发疼痛，多因肩胛骨与胸廓异常摩擦导致。物理治疗如关节松动术和姿势训练可缓解症状。
严重畸形可能压迫臂丛神经或伴随颈椎肋骨畸形，出现放射性疼痛。需通过影像学评估是否需手术矫正。
长期异常力学负荷可能引发肩袖损伤或骨关节炎，表现为夜间痛和活动受限。可考虑关节镜探查或肩胛骨成形术。
日常应注意保持正确坐姿，避免长时间伏案工作，游泳等对称性运动有助于改善肌肉平衡。疼痛持续加重需及时就诊骨科或康复科。
