衣原体支原体感染的严重程度因个体差异而异，多数情况下属于轻度感染，但可能引发尿道炎、宫颈炎等疾病，少数情况下会导致肺炎或全身性并发症。
多数衣原体支原体感染表现为轻微症状或无症状，可通过阿奇霉素、多西环素、左氧氟沙星等抗生素治疗，及时用药可完全康复。
感染可能引起泌尿生殖系统炎症，如尿道分泌物异常、下腹痛等症状，需规范使用抗生素并复查确保病原体清除。
肺炎支原体感染可能导致顽固性咳嗽、发热等呼吸道症状，儿童及免疫力低下者可能出现重症，需住院静脉用药治疗。
未经治疗的感染可能诱发反应性关节炎、盆腔炎或不孕症等远期危害，孕期感染还可能造成新生儿结膜炎或肺炎。
建议感染者完成全程抗生素治疗，治疗期间避免性接触，定期复查直至病原体转阴，伴侣需同步检查治疗以防重复感染。
