肝囊肿通常无须药物治疗，体积较小且无症状者可定期观察，若出现感染或压迫症状可遵医嘱使用头孢呋辛、甲硝唑等抗生素，或穿刺引流联合无水乙醇硬化治疗。
合并细菌感染时可使用头孢呋辛、甲硝唑、左氧氟沙星等药物控制炎症，需配合影像学评估囊肿变化。
超声引导下穿刺抽液后注入无水乙醇，可使囊肿内壁细胞失活，降低复发概率，适用于直径超过5厘米的单纯性囊肿。
腹腔镜下囊肿开窗术或肝部分切除术适用于巨大囊肿、反复感染或疑似恶变者，需结合肝功能评估手术方案。
疼痛明显者可短期使用布洛芬缓解症状，但须排除胆道梗阻等禁忌症，避免掩盖病情进展。
日常避免肝区外力撞击，每6-12个月复查超声监测囊肿变化，合并高血压或糖尿病者需优先控制基础疾病。
