巴贝虫病可以通过药物治疗治愈，治疗方案主要包括抗寄生虫药物、支持治疗、对症处理以及预防并发症。
阿奇霉素联合阿托伐醌是轻中度感染的首选方案，重症患者可选用克林霉素联合奎宁，用药需严格遵循医嘱完成疗程。
贫血患者可补充铁剂与叶酸，严重溶血时需输血；发热期应卧床休息并保证水分摄入，维持电解质平衡。
高热可使用对乙酰氨基酚退热，肌肉疼痛可短期服用布洛芬，出现黄疸需进行肝功能保护治疗。
脾破裂患者需紧急手术，急性肾衰竭需血液透析，合并其他感染时应针对性使用抗生素。
治疗期间需监测血常规与肝功能，避免蚊虫叮咬防止重复感染，治愈后仍应定期复查抗体水平。
