慢性结肠炎多数情况下属于可控的慢性疾病，严重程度主要取决于炎症范围、病理类型及并发症。
局限性的轻中度炎症通常症状轻微，表现为间歇性腹痛腹泻；广泛性结肠受累可能出现持续血便、消瘦等重度症状。
常见的溃疡性结肠炎若仅累及直肠（直肠炎型）预后较好，全结肠型或克罗恩病合并肠瘘等特殊情况则需积极干预。
病程超10年且全结肠受累者癌变概率增加，急性发作期可能发生中毒性巨结肠等危急并发症。
对5-氨基水杨酸制剂反应良好的患者预后较佳，需生物制剂或手术干预者疾病负担相对较重。
建议定期肠镜监测，保持低渣饮食，避免生冷刺激食物，在医生指导下使用美沙拉嗪、泼尼松等药物控制炎症。
