慢性腹泻多数可以控制或治愈，治疗难度与病因有关，常见原因包括肠易激综合征、炎症性肠病、乳糖不耐受、肠道感染等，需针对病因采取饮食调整、药物干预等措施。
可能与精神压力、胃肠动力异常有关，表现为腹痛伴腹泻，可遵医嘱使用蒙脱石散、双歧杆菌三联活菌胶囊、匹维溴铵等药物调节肠道功能。
克罗恩病或溃疡性结肠炎可能导致持续腹泻，常伴随血便或体重下降，需使用美沙拉嗪、泼尼松等抗炎药或生物制剂控制病情。
因乳糖酶缺乏导致进食乳制品后腹泻，通过无乳糖饮食可改善症状，必要时补充乳糖酶制剂帮助消化。
贾第鞭毛虫等寄生虫感染可引起长期腹泻，需通过粪便检测确诊后使用甲硝唑、阿苯达唑等驱虫药物治疗。
慢性腹泻患者需记录饮食与症状关联，避免高脂辛辣食物，急性发作时可口服补液盐预防脱水，持续2周以上症状应完善肠镜等检查。
