小茴香具有促进消化、缓解胀气、调节胃肠功能、抗菌消炎等功效，适合胃肠不适者适量食用，也可遵医嘱使用小茴香油、小茴香提取物、小茴香胶囊、小茴香颗粒等药物辅助治疗。
小茴香中的挥发油成分能刺激消化液分泌，帮助分解食物，改善食欲不振或饭后饱胀感。胃肠功能紊乱者可日常冲泡小茴香茶饮用。
小茴香能松弛胃肠平滑肌，减少肠道气体堆积，对腹胀、肠鸣有明显缓解作用。建议将小茴香籽炒热后外敷腹部。
小茴香可双向调节胃肠蠕动，既能缓解腹泻又能改善便秘。慢性胃肠炎患者可用小茴香配合米粥食用。
小茴香精油对大肠杆菌等致病菌有抑制作用，能减轻胃肠黏膜炎症。急性肠炎发作期可在医生指导下使用含小茴香成分的止泻药物。
使用小茴香时需注意过敏反应，孕妇及哺乳期女性应咨询医师，胃肠疾病急性发作期应及时就医明确诊断。
