煮熟的菱角比生吃更健康，主要因为高温加热能破坏菱角中的抗营养物质、提升淀粉消化率、降低寄生虫感染风险。
菱角含有胰蛋白酶抑制剂和凝集素等抗营养物质，生吃可能干扰蛋白质吸收并引发胃肠不适。加热过程可使这些成分失活，减少对消化系统的刺激。菱角淀粉在生状态下属于抗性淀粉，煮熟后转化为更易消化吸收的糊化淀粉，营养利用率显著提高。淡水水生植物易附着寄生虫卵，煮沸能有效杀灭肝吸虫等病原体。传统烹饪方法还能分解部分致敏蛋白，降低过敏反应概率。
生菱角虽然保留更多维生素C等热敏性营养素，但可能引发腹部绞痛、腹泻等不良反应。未充分加热的菱角表皮可能存在姜片虫囊蚴，误食后可能导致寄生虫在胆管寄生。部分人群生食后会出现舌麻、咽喉刺痒等过敏症状，加热可减轻这类反应。某些品种菱角含微量氰苷类物质，充分烹煮能促进其分解。
建议采用沸水煮15分钟以上或蒸制20分钟的烹饪方式，确保中心温度达到杀菌要求。食用前需彻底清洗表面淤泥，去除残留菱角壳刺。消化功能较弱者及儿童应避免尝试生食，过敏体质人群首次食用需控制少量。妥善保存的熟菱角冷藏不宜超过2天，再食用时需重新加热。
