甲状腺功能减退症患者预期寿命与常人相近，规范治疗下通常不影响自然寿命。生存期主要取决于甲状腺功能水平控制、并发症管理、合并疾病干预、治疗依从性四个关键因素。
持续维持血清促甲状腺激素在目标范围可避免脏器损伤。初期每3个月复查甲状腺功能，稳定后每年监测1次，左甲状腺素钠是主要替代药物。
未控制的甲状腺功能减退可能诱发粘液性水肿昏迷、心血管疾病。定期检查血脂、心电图，出现嗜睡或低体温需急诊处理。
合并桥本甲状腺炎需监测抗体水平，伴发冠心病者需协同调整甲状腺素与心血管药物剂量，避免治疗矛盾。
坚持每日空腹服用左甲状腺素钠，避免与钙剂、铁剂同服。自行减药或停药可能导致症状反复，影响长期预后。
患者应保持均衡饮食，适量摄入含碘食物，避免卷心菜等致甲状腺肿物质，配合适度运动维持基础代谢率。
