一肿瘤基因分析。脊椎动物存在由反转录病毒引起肿瘤的病毒癌基因。细胞肿瘤基因控制细胞增生，如c-erb与鸟类中的红细胞、白血病v-erb同源。Ras与v-ras参与细胞周期的信号传导。fas调节细胞死亡和基因表达，通过PCRFISH等检测。免疫组化技术检测肿瘤基因产物，如在乳腺肿瘤中c-erb了解预后者转移，淋巴组织中检测bcl-2鉴别淋巴瘤组织的反应性增生或滤泡型淋巴瘤，对抑癌基因、p53十分重要。二基因重排。染色体移位、B细胞淋巴瘤、免疫球蛋白重排包括T淋巴细胞瘤、T细胞表面受体的重排。恶性肿瘤染色体易位如Burkitt's淋巴瘤8号和14号易位，套细胞淋巴瘤11号和14号易位，Ewing氏肉瘤11号和22号易位，腺泡型横纹肌肉瘤2号和13号易位等。四检测感染性病原。如HPV感染的和宫颈癌相关性，EBV淋巴瘤，EBV阳性鼻咽癌，HSV卡波西肉瘤，结核杆菌TB等。五检测微小残留病灶。
