输尿管镜手术过程中通常不会感到明显痛苦，手术采用麻醉方式减轻不适感。输尿管镜手术主要用于治疗输尿管结石、输尿管狭窄等疾病，属于微创手术方式。
输尿管镜手术在全身麻醉或椎管内麻醉下进行，患者处于无意识状态或下半身暂时失去知觉，手术过程中不会感受到疼痛。麻醉药物会阻断痛觉神经传导，医生通过尿道置入纤细的内窥镜器械进行操作，器械直径较小，对尿道的刺激较轻。术后麻醉效果消退后可能出现轻微尿道不适或排尿刺痛，这种不适感多数在1-2天内逐渐缓解。部分患者术后可能出现血尿症状，与手术操作刺激尿路黏膜有关，通常呈现淡红色，2-3天后会自行消失。
少数患者术后可能出现较明显疼痛，多见于输尿管结石较大、手术时间较长的情况。结石体积较大时需要进行激光碎石，可能对输尿管壁造成一定刺激。手术中放置双J管也可能引起腰部胀痛，尤其在排尿时症状可能加重。存在输尿管狭窄的患者，术中需要进行扩张操作，术后可能出现较明显的痉挛性疼痛。这些情况导致的疼痛程度因人而异，医生会根据具体情况给予止痛药物缓解。
术后应多饮水促进排尿，减少血尿持续时间。避免剧烈运动防止双J管移位，饮食宜清淡少刺激。出现发热、持续严重疼痛或血尿加重等情况需及时就医复查，排除感染等并发症。术后1-2周需按医嘱返院取出双J管，期间注意观察排尿情况。
