生殖器疱疹存在误诊可能，主要与症状相似疾病混淆、检测方法局限性等因素有关。误诊常见于梅毒、软下疳、固定性药疹、接触性皮炎等疾病，需结合临床表现与实验室检查综合判断。
1、症状相似疾病生殖器疱疹的溃疡、水疱表现易与其他性传播疾病混淆。梅毒硬下疳初期为无痛性溃疡，二期梅毒疹可模拟疱疹皮损；软下疳溃疡边缘不规则且伴明显疼痛；固定性药疹有明确用药史且皮损形态单一。临床需通过血清学检测、病原体培养等方法鉴别。
2、检测方法局限单纯疱疹病毒抗体检测可能出现假阳性或假阴性。IgM抗体在感染初期可能未产生，IgG抗体无法区分既往感染与现症感染。病毒培养阳性率随病程延长下降，PCR检测对实验室条件要求较高。建议在皮损出现24-48小时内采集样本提高检出率。
3、非感染性疾病干扰接触性皮炎、白塞病、克罗恩病等非感染性疾病可能表现为生殖器溃疡。接触性皮炎有过敏原接触史伴剧烈瘙痒；白塞病合并口腔溃疡与眼炎；克罗恩病伴随消化道症状。需详细询问病史并完善组织病理学检查。
4、不典型临床表现免疫抑制患者可能出现无痛性溃疡或广泛坏死性皮损，易误诊为恶性肿瘤或深部真菌感染。HIV感染者疱疹皮损常持续超过1个月且累及肛周、直肠。对于免疫功能低下者建议进行HSV-DNA定量检测。
5、混合感染影响合并HIV、梅毒等其他感染时症状相互掩盖。梅毒与疱疹混合感染时溃疡基底可能既呈软骨样硬度又伴群集性水疱。推荐对所有生殖器溃疡患者进行HIV筛查与梅毒螺旋体暗视野检查。
出现生殖器皮损时应避免自行用药，及时至皮肤性病科就诊。医生会通过醋酸白试验、Tzanck涂片等快速筛查，结合HSV-2型特异性血清学检测明确诊断。保持患处清洁干燥，穿宽松棉质内衣，治疗期间禁止性接触。复发患者可遵医嘱使用阿昔洛韦片、泛昔洛韦胶囊、伐昔洛韦颗粒等抗病毒药物抑制发作。
