3个月婴儿拉肚子是否自愈需结合病因判断，多数由喂养不当或病毒感染引起的轻度腹泻可能自愈，但细菌感染或乳糖不耐受等情况通常需要干预。
母乳喂养不当或奶粉冲调过浓可能导致胃肠负担加重，表现为大便次数增多、质地稀薄。调整喂养方式后，婴儿肠道功能往往在3-5天内逐渐恢复。病毒感染引起的腹泻通常伴随低热、食欲下降，病程约5-7天，期间注意补充口服补液盐防止脱水即可。
细菌性肠炎会出现黏液便、血便等异常排泄物，可能伴随持续发热，这种情况需及时进行大便常规检查，必要时使用头孢克肟颗粒等抗生素治疗。先天性乳糖酶缺乏的婴儿会反复出现水样便、腹胀，需要改用无乳糖配方奶粉喂养。早产儿或免疫力低下婴儿的腹泻症状更容易加重，可能出现尿量减少、精神萎靡等脱水表现。
建议家长记录婴儿每日排便次数、性状变化及伴随症状。保持臀部清洁干燥，每次便后用温水清洗并涂抹氧化锌软膏预防红臀。若腹泻超过3天未缓解，或出现拒奶、嗜睡、前囟凹陷等表现，须立即就医进行便常规、轮状病毒抗原检测等检查。母乳喂养的母亲应避免进食生冷刺激食物，奶粉喂养者需严格按比例冲调。
