成年卵圆孔未闭多数情况不严重，但可能增加脑卒中或偏头痛风险。卵圆孔未闭的处理方式主要有定期随访、药物治疗、介入封堵、外科手术。
无症状且无并发症的卵圆孔未闭通常建议定期心脏超声检查，监测是否出现异常血流或心脏结构变化。
出现反常性栓塞风险时可使用抗血小板药物，如阿司匹林肠溶片、氯吡格雷片，或抗凝药物华法林钠片。
对于合并脑卒中或顽固性偏头痛的患者，可能需行经导管卵圆孔封堵术，该微创手术通过植入封堵器闭合异常通道。
极少数合并复杂心脏畸形或封堵失败者需开胸手术修补，但需评估手术风险与获益。
建议避免潜水等可能诱发栓塞的高压环境，出现不明原因卒中或反复偏头痛时应及时就诊心内科评估。
