适量食用巧克力可能有助于心血管健康、改善情绪，但过量可能引发肥胖或胃肠不适。巧克力的主要成分可可含有抗氧化物质，而添加糖和脂肪可能增加健康风险。
巧克力中的可可多酚具有抗氧化作用，可能帮助降低血压、改善血管内皮功能。黑巧克力中可可含量较高，对心脑血管的保护作用相对明显。牛奶巧克力和白巧克力因添加乳制品和糖分，营养价值相对降低。适量摄入巧克力可能刺激大脑释放内啡肽和血清素，有助于缓解焦虑情绪。部分研究显示可可黄烷醇可能改善认知功能，但需要更多临床证据支持。
巧克力含糖量较高可能增加龋齿风险，长期过量摄入易导致热量过剩。代可可脂制作的巧克力含有反式脂肪酸，可能升高低密度脂蛋白胆固醇水平。部分人群食用后可能出现胃酸分泌增多、烧心等不适。巧克力中的可可碱和咖啡因可能引起敏感者心悸或失眠。儿童过量食用可能影响正餐食欲，干扰营养均衡摄入。
建议选择可可含量超过70％的黑巧克力，每日摄入量控制在20-30克。胃肠功能较弱者避免空腹食用，糖尿病患者应选择无糖品种。食用后注意口腔清洁，儿童需在家长监督下控制摄入量。如出现心悸、失眠等不适症状应及时停止食用并咨询医生。
