适量食用黑蒜有助于补充营养、调节胃肠功能、增强免疫力、抗氧化及辅助调节血脂。黑蒜是新鲜大蒜经发酵制成的食品，其活性成分和营养价值有所提升。
黑蒜含有丰富的氨基酸、维生素B族及微量元素硒。发酵过程中大蒜素转化为更易吸收的S-烯丙基半胱氨酸，可帮助改善贫血或营养不良状态。胃肠功能较弱者建议每日食用1-2瓣。
黑蒜中的低聚果糖能促进双歧杆菌增殖，改善肠道微生态。其温和刺激性较生蒜显著降低，适合慢性胃炎患者适量食用，但急性胃肠炎发作期应暂停摄入。
黑蒜含有的蒜氨酸酶衍生物可激活巨噬细胞，提升机体对流感病毒的防御能力。长期吸烟或接触污染环境人群可将其作为膳食补充，但不可替代药物治疗。
发酵使黑蒜的多酚含量增加，其清除自由基能力是普通大蒜的2-3倍。所含的S-烯丙基巯基半胱氨酸能减缓皮肤胶原蛋白降解，中老年人适量食用有助于延缓衰老。
黑蒜中的硫化物可抑制胆固醇合成酶活性，辅助降低低密度脂蛋白。轻度血脂异常者配合运动锻炼效果更佳，但严重高脂血症患者仍需规范用药。
食用黑蒜需注意每日不超过3瓣，避免空腹食用引发胃部不适。糖尿病患者应计入每日碳水化合物总量，术后患者及正在服用抗凝药物者需咨询医师。建议选择无添加糖分的自然发酵产品，搭配均衡膳食效果更佳，出现过敏症状应立即停用。
