肛瘘和脓肿的严重程度需根据具体病情判断，肛瘘通常比脓肿更严重。肛瘘是肛周脓肿破溃或切开引流后形成的慢性感染性管道，脓肿是急性化脓性炎症反应。
肛周脓肿主要表现为肛周红肿热痛，可伴有发热等全身症状，及时切开引流后多数能痊愈。若治疗不及时可能发展为肛瘘。肛瘘因存在慢性感染管道，可能反复发作流脓、疼痛，长期不愈可导致肛门括约肌损伤甚至失禁。复杂性肛瘘可能形成多条瘘管，治疗难度更大。
部分高位肛周脓肿可能引发脓毒血症等严重并发症，此时病情危急程度超过普通肛瘘。但肛瘘因病程迁延、复发率高且可能造成肛门功能损害，其长期危害性通常大于脓肿。
无论肛瘘或脓肿均需尽早就医，脓肿期规范治疗可避免形成肛瘘。日常需保持肛周清洁干燥，避免久坐及辛辣刺激饮食，出现肛周肿痛应及时肛肠科就诊，通过直肠指诊、超声或磁共振明确诊断后针对性处理。
