肛门闭锁的治疗效果通常取决于手术矫正时机和方式，主要方法有会阴肛门成形术、骶会阴肛门成形术、腹会阴肛门成形术、术后扩肛护理等。
1、会阴肛门成形术适用于低位肛门闭锁，通过会阴部切口重建肛门，术后需配合扩肛训练帮助恢复排便功能。
2、骶会阴肛门成形术针对中位闭锁类型，结合骶尾部与会阴部联合入路，术中需精准分离直肠盲端与括约肌复合体。
3、腹会阴肛门成形术适用于高位闭锁病例，经腹腔游离直肠后下拉至会阴，需特别注意保留直肠血供及神经支配。
4、术后扩肛护理所有术式均需持续扩肛3-6个月，使用专用扩肛器逐步扩大新建肛门，预防瘢痕狭窄。
术后需定期评估排便功能，配合生物反馈训练和饮食管理，多数患儿可获得满意疗效。
