多数脑炎患者经过规范治疗可以治愈，预后与病因、病情严重程度、治疗时机等因素有关，病毒性脑炎、细菌性脑炎、自身免疫性脑炎等类型需针对性治疗。
常见由单纯疱疹病毒、肠道病毒等引起，表现为发热、头痛、意识障碍。抗病毒药物如阿昔洛韦、更昔洛韦、膦甲酸钠可抑制病毒复制，重症需联合免疫调节治疗。
多由肺炎链球菌、脑膜炎奈瑟菌感染导致，伴随颈强直、喷射性呕吐。需静脉注射抗生素如头孢曲松、万古霉素、美罗培南，及时治疗多数可完全康复。
与抗NMDA受体抗体等相关，可能出现精神行为异常、癫痫发作。免疫治疗包括糖皮质激素、丙种球蛋白、利妥昔单抗，部分患者需长期免疫抑制维持。
严重脑炎可能遗留认知障碍、运动功能障碍等后遗症，需通过康复训练、营养支持及定期随访改善预后，早期干预有助于功能恢复。
脑炎患者应保证充足营养摄入，急性期卧床休息，恢复期逐步进行认知与肢体康复训练，定期复查脑电图或影像学评估恢复情况。
