轻微脑炎通常不会留下明显后遗症，但部分患者可能出现记忆力减退、注意力不集中、情绪波动等轻微症状，具体与个体差异、治疗时机、病原体类型、并发症等因素有关。
1、个体差异儿童或老年人因神经系统代偿能力较弱，恢复期可能较长，建议定期随访评估认知功能。
2、治疗时机延误抗病毒或抗感染治疗可能导致神经元损伤加重，早期规范使用阿昔洛韦、更昔洛韦等药物可降低后遗症概率。
3、病原体类型单纯疱疹病毒性脑炎较易遗留颞叶损伤，表现为语言障碍或癫痫发作，需长期服用丙戊酸钠等抗癫痫药物。
4、并发症脑水肿或颅内压增高未及时控制时，可能造成运动协调障碍，康复训练联合甲钴胺营养神经有助于功能恢复。
恢复期保证优质蛋白和B族维生素摄入，避免剧烈运动，若出现持续头痛或性格改变应及时复查脑电图。
