肉孢子虫病潜伏期一般为3天至6周，实际时间受到感染虫体数量、宿主免疫力、虫株毒力、感染途径等多种因素的影响。
1、虫体数量摄入含肉孢子虫包囊的生肉量越大，潜伏期可能越短。虫体快速繁殖会导致更早出现肌肉疼痛、发热等症状。
2、宿主免疫免疫功能低下者潜伏期较短。艾滋病患者或长期使用免疫抑制剂的人群可能出现更快进展的消化道症状和全身感染表现。
3、虫株差异不同肉孢子虫种类致病性不同。人肌肉肉孢子虫潜伏期通常较长，而肠道型肉孢子虫感染可能出现更早的腹泻、腹痛症状。
4、感染途径经口摄入污染食物是主要感染方式，但直接接触患病动物也可能感染。后者潜伏期相对更不稳定。
建议避免食用未煮熟的肉类，处理生肉后彻底洗手，免疫功能异常者出现不明原因肌痛或腹泻应及时就医排查。
