柏子仁具有养心安神、润肠通便等功效，主要用于改善心悸失眠、肠燥便秘等症状。
柏子仁归心经，能缓解心阴不足引起的心悸、失眠多梦。临床常与酸枣仁配伍使用，适用于神经衰弱或更年期综合征患者。可遵医嘱使用柏子养心丸、天王补心丹等中成药。
富含油脂成分可润滑肠道，改善老年人或产后血虚导致的便秘。常与火麻仁、郁李仁同用，对应方剂如五仁丸。肠梗阻患者禁用。
对阴虚盗汗有收敛作用，多与煅牡蛎、麻黄根配伍。肺结核或甲亢患者出现夜间汗多时，可在医生指导下使用柏子仁配伍方剂。
辅助改善肝肾阴虚导致的头晕耳鸣、腰膝酸软。常与熟地黄、山茱萸同用，如左归丸。糖尿病患者服用需监测血糖。
使用柏子仁前需辨证施治，脾虚便溏者慎用，建议在中医师指导下配伍使用，避免与刺激性泻药同服。
