肠道菌群分析是通过检测粪便样本评估肠道微生物组成的技术，肠道菌群宏基因组测序则是对微生物全部基因进行高通量测序的方法。
1、检测原理肠道菌群分析采用16S rRNA基因测序技术，通过细菌保守序列识别微生物种类和丰度，适用于菌群结构初步筛查。
2、技术差异宏基因组测序能获取全部微生物基因信息，包括功能基因和代谢通路，较16S测序具有更高分辨率和功能分析深度。
3、临床应用主要用于肠道菌群失调相关疾病诊断，如炎症性肠病、肠易激综合征、代谢综合征等慢性疾病的辅助评估。
4、操作流程需采集新鲜粪便样本，经DNA提取、文库构建和生物信息学分析，最终生成菌群组成报告和功能预测结果。
检测前需停用抗生素和益生菌至少两周，采样后需低温保存并尽快送检，结果解读需结合临床症状由专业医师完成。
