慢性鼻咽炎通过规范治疗和长期管理通常可以控制症状，但完全治愈存在一定难度。慢性鼻咽炎的治疗效果主要与病因控制、个体差异、治疗依从性等因素相关。
慢性鼻咽炎若由环境刺激或不良生活习惯引起，通过消除诱因并配合药物治疗，症状可显著缓解甚至长期不复发。例如粉尘或烟雾暴露者脱离污染环境后，联合使用鼻用糖皮质激素喷剂如布地奈德鼻喷雾剂、生理盐水鼻腔冲洗、口服黏液溶解剂如桉柠蒎肠溶软胶囊等，多数患者鼻咽部充血和分泌物增多症状能得到有效控制。此类患者定期复查并坚持鼻腔护理，部分病例可达到临床治愈标准。
当慢性鼻咽炎合并鼻中隔偏曲、腺样体肥大等解剖结构异常，或伴随胃食管反流、免疫缺陷等系统性疾病时，单纯药物治疗难以根治。这类患者可能需要鼻内镜手术矫正解剖异常，同时需针对原发病进行干预。即便经过系统治疗，黏膜慢性炎症改变可能持续存在，需长期随访管理。过敏性体质或遗传易感人群也易出现病情反复，此类情况更强调症状控制而非追求生物学治愈。
慢性鼻咽炎患者应保持鼻腔湿润，避免接触冷空气和刺激性气体，戒烟限酒并保证充足睡眠。建议每6-12个月进行鼻咽部内镜复查，根据黏膜恢复情况调整治疗方案。急性发作期及时就医，在医生指导下调整用药方案，不可自行长期使用减充血剂。日常可练习鼻腔呼吸操增强黏膜防御功能，饮食注意补充维生素A和锌元素促进黏膜修复。
