医生建议不用牙线通常与患者存在特殊口腔情况有关，例如牙龈萎缩、牙间隙过大或正在进行正畸治疗等。牙线使用不当可能损伤牙龈或影响矫治器稳定性，需根据个体情况选择替代清洁工具。
部分患者因牙龈严重萎缩导致牙根暴露，牙线摩擦可能加剧敏感或引发疼痛。这类人群更适合使用软毛牙刷配合冲牙器清洁，既能减少机械刺激，又能有效清除邻面菌斑。正畸患者佩戴固定矫治器时，牙线可能被托槽钩住造成弓丝变形，此时需改用正畸专用间隙刷或单束刷清洁托槽周围。
存在严重牙周炎急性发作期的患者，牙龈红肿脆弱时暂时停用牙线可避免出血和感染风险。建议先进行牙周基础治疗控制炎症，待牙龈恢复健康状态后，在医生指导下重新学习正确使用牙线的方法。某些特殊修复体如种植牙冠邻接过紧时，强行使用牙线可能导致修复体松动，需选用超细牙线或专业种植体清洁工具。
日常口腔护理应定期接受专业检查，根据牙医评估调整清洁方案。除特殊人群外，正确使用牙线仍是预防邻面龋的有效手段，但需掌握C形环绕式操作手法，避免暴力锯割式使用。对于儿童或手部活动受限者，可选用牙线棒辅助操作，必要时配合菌斑显示剂检查清洁效果。