双眼皮两只眼睛不一样通常是正常的生理现象，可能与遗传、发育差异等因素有关。若伴随红肿、疼痛等症状，可能与外伤、眼部疾病等因素有关。建议观察症状变化，必要时就医检查。
多数情况下双眼皮不对称属于先天性发育差异，与遗传基因或胚胎发育过程中眼睑肌肉、脂肪分布不均有关。这种差异通常不影响视力功能，外观差异也较轻微。部分人群在青春期后面部骨骼发育变化可能使双眼皮褶皱逐渐对称。日常可通过调整化妆技巧或使用双眼皮贴暂时改善外观。
少数情况下可能因外伤导致眼睑血肿机化、提上睑肌损伤，或眼部疾病如眼睑下垂、麦粒肿愈后瘢痕形成等病理因素引起。这类情况常伴随睁眼费力、眼睑肿胀或结膜充血等症状。若因过敏反应导致单侧眼睑水肿，可能短期内出现明显不对称。眼部手术如双眼皮成形术操作不当也可能造成术后双侧形态差异。
建议避免揉搓眼睛或自行使用不明成分的眼部产品。日常注意用眼卫生，控制电子产品使用时间。若不对称持续加重或伴随视力模糊、复视等症状，需及时至眼科排查重症肌无力、甲状腺相关眼病等全身性疾病。对于影响功能的严重不对称，可通过眼睑矫正手术改善。