引起先天性肛门括约肌失禁的原因是肛门括约肌发育不良。肛门括约肌是位于直肠末端的环状肌肉，其作用是控制排便和尿潮。然而，在一些婴儿或儿童身上，这一肌肉可能没有正常发育，导致了先天性肛门括约肌失禁的现象。
这种不良发育的原因有多种。遗传因素在先天性肛门括约肌失禁的发生中起到了关键作用。一些基因突变可能导致肛门括约肌组织的异常发育，进而导致失禁问题。胎儿在子宫中发育过程中，受到了一系列胎儿发育异常的可能影响，如胎儿筋弛缓综合症、神经管闭合不全等。这些异常发育可能导致肛门括约肌的正常组织构建受到干扰，进而引发失禁问题。
外部环境因素也可能对肛门括约肌的发育产生不良影响。例如，母体在孕期受到感染、暴露于有害物质或药物时，都有可能对胎儿的发育造成干扰。这些外部环境的干扰可能干扰了肛门括约肌的正常生长和发育，导致了先天性肛门括约肌失禁的现象。
引起先天性肛门括约肌失禁的原因主要是肛门括约肌组织发育不良。遗传因素、胎儿异常发育以及外部环境因素都可能影响肛门括约肌的正常发育，导致了先天性肛门括约肌失禁的出现。了解这些原因对于早期预防和治疗先天性肛门括约肌失禁非常重要。
