指甲和耳软骨出现褐色色素沉着主要是由于黑色素在这些部位的沉着引起的。黑色素是一种由细胞产生的色素，常见于皮肤、毛发和眼睛等部位。在指甲和耳软骨中，黑色素的沉着可能是由以下几个原因引起的。

年龄是导致黑色素沉着的一个常见因素。随着年龄的增长，黑色素的产生和沉着会逐渐增加。这是因为皮肤中的黑色素细胞逐渐减少，黑色素的合成速度变慢，使得黑色素在指甲和耳软骨中的沉着增加。

紫外线照射也会导致黑色素沉着。长时间暴露在阳光下，特别是直接照射到指甲和耳软骨的部位，会刺激黑色素的产生和沉着。这也是为什么一些人在夏天容易出现黑色素沉着的原因之一。

另外，内分泌的变化也可能导致黑色素沉着。一些内分泌紊乱的疾病，如甲状腺功能亢进或肾上腺皮质功能亢进，会使黑色素的合成和沉着增加，进而导致指甲和耳软骨出现褐色色素沉着。

某些药物的使用也可能引起黑色素沉着。一些含有黑色素的化妆品或药物，如退瓶酸、四环素等，会导致黑色素在指甲和耳软骨中沉积。

要预防和减少黑色素沉着的现象，可以采取以下措施。避免长时间暴露在强烈的阳光下，特别是中午时段。注意调节内分泌的平衡，避免激素紊乱。如果正在使用某些可能导致黑色素沉着的药物，应及时咨询医生是否需要调整用药。定期进行美甲和耳部清洁，保持指甲和耳软骨的清洁健康。