燕耳和银耳在来源、外观、营养成分及食用功效上存在明显差异，燕耳是金丝燕的唾液凝结物，银耳是真菌类植物。
燕耳又称燕窝，由雨燕科金丝燕分泌的唾液混合羽毛等物质筑巢形成，呈半月形或船形，质地脆硬，颜色多为白色、黄色或红色，富含唾液酸、蛋白质和矿物质，传统中医认为其具有滋阴润肺、养颜美容的功效。银耳属于担子菌门银耳科，人工栽培为主，形似花朵，质地柔软胶质，干燥后为淡黄色，泡发后呈半透明状，含多糖类物质、膳食纤维及少量蛋白质，主要功效为润肠通便、增强免疫力。
燕耳因采集困难且产量稀少，价格昂贵，多用于高端滋补品；银耳种植广泛，成本较低，日常饮食中更常见。两者均需长时间炖煮，但燕耳需更精细的挑毛处理，银耳可直接泡发使用。过敏体质者需谨慎食用燕耳，银耳则需注意避免变质产生毒素。
日常食用可根据需求选择:燕耳适合经济条件允许且追求特定滋补效果的人群，建议隔水炖煮保留营养；银耳性价比高，可搭配红枣、枸杞等食材制作甜品，但需确保充分泡发和煮熟。储存时燕耳需密封防潮，银耳应避免受潮霉变。若出现食用后皮肤瘙痒、腹泻等不适，应立即停用并就医。