银耳对胃肠的影响需结合食用方式和个体差异判断，适量食用通常有助于养胃，过量或不当食用可能伤胃。
银耳富含膳食纤维和植物胶质，能促进胃肠蠕动并形成保护膜，对慢性胃炎、胃酸过多者有缓解作用。其多糖成分可调节肠道菌群，改善消化功能。但银耳质地较硬，未经充分泡发或炖煮可能刺激胃黏膜，引发腹胀、反酸等症状。消化功能较弱者短期大量摄入可能加重胃肠负担。银耳性偏寒凉，脾胃虚寒者空腹食用易出现腹泻。
变质银耳产生的米酵菌酸具有强毒性，会直接损伤胃黏膜细胞。银耳与高蛋白食物同食可能影响蛋白质消化吸收。部分人群对银耳存在过敏反应，食用后会出现胃痛、呕吐等过敏症状。术后胃肠功能未恢复者食用银耳可能引发肠梗阻。
建议选择充分泡发4-6小时的优质银耳，采用炖煮1小时以上的烹饪方式，每周食用2-3次且每次不超过15克干品。脾胃虚寒者可搭配红枣、生姜等温性食材。出现胃部不适应立即停食，胃肠疾病急性发作期、术后恢复期及银耳过敏者应避免食用。日常可将银耳与小米、南瓜等易消化食材搭配，避免与海鲜、豆类等高蛋白食物同餐食用，食用后注意观察排便情况。