金匮肾气丸通常可与六味地黄丸、右归丸等中成药搭配使用，也可与枸杞、山药等药食同源食材配合调理。
金匮肾气丸以温补肾阳为主要功效，适用于肾阳虚引起的腰膝酸软、畏寒肢冷等症状。与六味地黄丸联合使用时，可形成阴阳双补的效果，适用于阴阳两虚证。右归丸同为温补肾阳类药物，联合使用可增强温补肾阳的作用。药食搭配方面，枸杞具有滋补肝肾的功效，山药能补脾益肾，两者均可增强金匮肾气丸的疗效。需注意避免与清热泻火类药物如黄连上清片同用，以免药效相抵。
服用金匮肾气丸期间应避免生冷食物，适量食用羊肉、核桃等温补类食材，用药期间出现口干舌燥等不适需及时就医调整用药方案。