药物流产多数情况下是安全的，但需严格在医生指导下进行，主要风险包括不完全流产、大出血、感染、药物过敏。
孕囊或蜕膜残留可能导致持续出血，需超声确认后行清宫术，可遵医嘱使用米索前列醇、米非司酮、缩宫素等药物>
子宫收缩不良或凝血功能障碍可能引发大出血，需急诊刮宫或输血，必要时使用氨甲环酸、酚磺乙胺等止血药物。
流产后宫腔开放易发生盆腔炎，表现为发热腹痛，需抗生素治疗如头孢曲松、甲硝唑、左氧氟沙星。
对米非司酮等成分过敏者可能出现皮疹休克，需立即停药并抗过敏治疗，可用氯雷他定、肾上腺素、地塞米松。
药物流产后应卧床休息，避免剧烈运动，两周内禁止盆浴性生活，出现发热或出血量大于月经量需立即就医。
